به گفته مشاور عالی و معاون امور کمیسیون ها و نظارت حرفه ای سازمان؛ کمسیون هایی که اخیراً در سازمان نظام تاسیس شده اند عبارتند از :
-
-کمیسیون های روان شناسی با رویکرد دینی
-مشاوره ازدواج در بستر فرهنگ دینی و بومی
-کمیسیون روان شناسی بالینی کودک 
-کمیسیون مشاوره توانبخشی روانی

بنا بر اعلام دکتر محمد حاتمی، کمیسیون مشاوره ازدواج در بستر فرهنگ دینی و بومی به عنوان یکی از کمیسیون های اصلی و راهبردی سازمان است که اعضای آن عبارتند از :
دکتر عباسعلی اللهیاری، دکتر غلامعلی افروز، دکتر نوابی نژاد، دکتر حسینیان، دکتر ثنایی ذاکر، دکتر محمود گلزاری، دکتر علی اصغر احمدی، دکتر محمد باقرحسینی، دکتر علی فتحی آشتیانی، دکتر محمد علی مظاهری، دکتر سید مهدی حسینی؛ که قرار است بزودی جلسات رسمی آن تشکیل شود .