طراحي مدل اتم به اتم از پوسته ويروس ايدز با کمک ابررايانه

گروهي متشکل از زيست شناسان، فيزيک دانان و پزشکان از دانشگاه هاي مختلف، با طراحي مدل اتم به اتم پوسته ويروس ايدز، اميدوارند اين مدل بتواند به توسعه داروهاي جديد با قابليت هدف قرار دادن کپسيد کمک کند.

به گزارش ايسنا، پوسته اي که ويروس HIV درون خود نگه مي دارد، جزئيات بي سابقه اي از اين ويروس را در اختيار محققان قرار مي دهد. اسيد نوکلئيک ويروس درون يک پوسته پروتئيني به نام کپسيد (Capsid) محصور شده است، زمان ورود ويروس به سلول بدن انسان، کپسيد به شيوه اي منظم جدا مي شود و امکان تصاحب سلول توسط ويروس را فراهم مي کند. کپسيد در برابر داروهاي خاص بسيار آسيب پذير است و محققان با کمک اين ويژگي در پي توسعه درمان هاي بالقوه هستند، اما هنوز داروي ضدايدز با قابليت هدف قرار دادن کپسيد توليد نشده است.

هم اکنون محققان براي نخستين بار موفق به طراحي مدلي از ساختار کپسيد ويروس HIV در ساختار اتمي، با استفاده از يک ابررايانه پرقدرت شدند که نحوه شکل دهي پروتئين ها بر سطح کپسيد را با جزئيات دقيق نشان مي دهد.

آن ها در تحقيقات خود دريافتند، کپسيد متشکل از ۲۱۶پروتئين به شکل ۶ضلعي منظم در کنار يکديگر مانند لانه زنبور است، در همين حال ۱۲پروتئين استراتژيک پنج ضلعي در اين پوسته وجود دارد که با ايجاد گوشه هاي تيز، يک مخروط باريک را تشکيل مي دهد.